在原來的劇情中，宇智波止水的一生都是一個悲劇，這源于他內心深處那天真的理想主義。
雖然表面，止水一直相信，宇智波一族與木葉村可以和諧共處。然而，他內心深處其實并不完全相信這個理想，或者說，潛意識里，他認為這是無法實現的。
正因為如此，他的萬花筒寫輪眼瞳術，才會覺醒了“別天神”這種能夠改變人意識的可怕瞳術。
止水是個理想主義者，但他理想的實現卻離不開現實的支撐。宇智波一族與木葉村之間的矛盾不斷加劇，止水的和平理想顯得格外渺茫。
同時，宇智波止水也是一個缺乏政治智慧的人，他盲目的寄希望于村子可以改變這一切，但是他卻沒有意識到，村子的上層，早就已經墮落，從一開始，他就走錯了方向。
正因為如此，在被團藏奪取了眼睛之后，止水終于認清了理想與現實的巨大差距。他意識到，自己無論如何努力，都無法改變家族與村子之間深刻的矛盾。
當他最終明白這一點時，他陷入了深深的絕望。
止水選擇了自殺，這不僅是對理想破滅的絕望，更是他對現實妥協的最后嘗試。他通過自己的死，成功將矛盾推遲了3年，并且讓宇智波鼬繼承了他的意志。
但總的來說，這是一個缺乏政治智慧的爛好人，甚至在判斷誰是敵人，誰是朋友這最基礎的事情上，都沒有做對。
不過在這條時間線里，止水的命運完全改變了。
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木葉四十八年的某一個夜晚，
宇智波止水獨自一人站在場中央，凝視著遠處的家族大宅。
他的心中充滿了矛盾與無奈，在此前的戰爭中，他已經意識到了村子和家族的矛盾，但他卻沒有絲毫的解決方法，這讓他十分的苦惱。
他已經遠見卓識的意識到了家族和村子的矛盾，如果不能和平解決，必定會產生斗爭，從而帶來新的戰爭，甚至導致木葉的毀滅。
他愛家族，但他更愛和平。
正當他沉思時，一個聲音從身后傳來。
“止水，你是否愿意聽聽我的建議？”
止水回頭，看到的來者，宇智波萱。
雖然止水沒有接觸過她，但已經聽聞過她的威名。
宇智波萱的眼神中閃爍著智慧的光芒，仿佛能洞悉一切。
“你看起來很苦惱啊，止水”
宇智波止水有點疑惑，自己苦惱這件事，平時表現得應該不明顯啊，對方是怎么發現的，而且，我和她應該不熟吧。
“我知道你心中的理想，但僅憑理想是無法改變現實的。你需要了掌握一些，了解這個世界，這個村子，如何運行的方法”
說著，宇智波萱拿出一本書，并丟給了止水
《木葉村原理》——這是日向暮根據前世所學的馬哲和偉人選集，寫的一本政治學教材。
“這是某人托我帶給你的書，他覺得，這本書應該能初步的解決你的問題”
說完，宇智波萱就轉身離去，留下一臉懵逼的宇智波止水。
雖然不明白對方的來意，但宇智波止水并沒有感受到而已，于是，打開了手中的書。
“權力是需要以力量為基礎的，沒有力量的權力就像是沒有牙齒的老虎。
作為影，他擁有一個村子至高無上的權利，可以在忍村之中制定法律、任免職位、決定戰爭與和平等。
然而，這些權力并不是憑空產生的，而是建立在影擁有的力量基礎之上的。
這種力量，并非僅僅是個人實力，還包括他追隨者的力量、他的政治智慧、經濟實力等多個方面。
個人實力是影非常直接、非常起作用的力量來源。
強大的實力，可以讓影對內壓制不服氣的忍者，對外面對其他忍村的挑戰時，也更有底氣。
但很多時候，政治智慧則更加重要，這是影們制定決策、駕馭忍者的關鍵……
經濟實力則是影能實現各種政策、進行戰爭的后盾。沒有足夠的經濟支持，再美好的政策也只是空中樓閣。
……
”
僅僅只看了一眼，止水就被完全的吸引了。
來自地球的政治思想，哲學，方法論和研究范式，對于這個時代的人來說，簡直是降維層面的打擊。
止水開始如饑似渴的閱讀起這本書，在這個過程中，他的思想也得到了巨大的升華。
他不再是一個空洞的理想主義者，而是逐漸形成了自己解決事情的方法論。
他發現，經過了這本書的指導，原本看起來一團亂麻的村子，家族以及各方之間的關系，竟然如抽絲剝繭一般，可以被理解，被改變了。
在這個過程中，他認識了這本書的作者，日向暮，并堅定的認可了他的想法。
想要挽救村子，拯救宇智波一族，直接倒向村子不行，一味的指望三代火影不行。
而是要以斗爭求團結。
此后，宇智波止水，就成了宇智波萱的副手，協助宇智波萱組建了家族的第三股勢力，并參與到對四代火影的投資中。
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回到現在，四代火影的辦公室中，
四代火影坐在辦公桌前，他的前面跪著一個帶著貍花貓面具的暗部。
“火影大人，已經查清楚了，關于人柱力生育時的風險，木葉的檔案中早有記載，只不過，三代大人在離職前，封存銷毀了所有檔案”
聽到了預想之中的答案，波風水門內心微微一沉，隨即一股憤怒的情緒涌上心頭。
我能理解你貪戀權勢的想法，但你不應該用玖辛奈的安危，來拿捏我。
看來，必須要做些動作了。
波風水門終于是下定了決心。
隨即他抬起頭，看下面前的暗部，微笑的說。
“止水，這里只有你我，不必這么拘束，你起來說話”
“關于上次宇智波萱的提議，我覺得，我們可以進一步探討一下……”
聽到這句話，宇智波止水心中微微一凜，終于要走到這一步了么。
不過也好，陳舊的枝椏，只會汲取樹木的養分，是時候斬斷它們了。